C3PO - Impact du Changement Climatique sur la sensibilité du Colza à deux agents Pathogènes majeurs : identification de leviers agrOnomiques, (épi-)génétiques et microbiens

Contexte et enjeux

Face aux défis climatiques, les grandes cultures, et notamment le colza d’hiver, sont confrontées à une évolution des pressions biotiques et abiotiques, qui modifient les interactions entre plantes et agents pathogènes. Ces interactions complexes soulèvent des questions sur les mécanismes de tolérance ou de sensibilité des plantes, et sur les leviers à mobiliser pour une protection durable des agroécosystèmes. Nos questionnements reposent sur deux constats principaux :

• des conditions climatiques particulières peuvent induire une tolérance à un stress biotique par un phénomène de tolérance croisée ou au contraire favoriser l’infection par l’agent pathogène, au cours d’un même cycle cultural ou entre générations
• des régulations à différentes échelles impliquant la plante/ graine, son phénotype étendu et/ou l’agent pathogène sont impliquées dans ces effets intra- ou intergénérationnels 

Ainsi les enjeux scientifiques et opérationnels du projet visent à :

• Agréger des connaissances sur les interactions plantes x pathogènes et les niveaux de régulations impliqués, dans un contexte de changement climatique chez le colza d’hiver
• Adapter les moyens de lutte actuels (pratiques agronomiques, résistances génétiques)
• Explorer de nouveaux leviers pour lutter contre ces bioagresseurs mobilisant le microbiote (graines, plantes, sol) et les régulations épigénétiques (plantes, champignons).

Objectifs 

Le projet C3PO vise à créer un consortium interdisciplinaire pour approfondir nos connaissances des effets du changement climatique sur la réponse (sensibilité/résistance) du colza d’hiver à deux maladies majeures (i.e. le phoma et la hernie des crucifères) et identifier des leviers pour atténuer/améliorer ces réponses. Nous proposons de créer un consortium national réunissant des scientifiques ayant des expertises complémentaires pour étudier l'impact du changement climatique sur la réponse du colza d'hiver à l'infection par deux agents pathogènes : Plasmodiophora brassicae, protiste tellurique, responsable de la hernie des crucifères infectant les racines et Leptosphaeria maculans, champignon aérien infectant les cotylédons et feuilles de colza avant de migrer dans la tige, responsable du phoma (nécrose du collet).

Au sein de ce consortium interdisciplinaire, nous chercherons à construire un cadre d'analyse de ces effets visant à mieux comprendre comment et par quels processus les conditions climatiques peuvent accentuer la sensibilité ou favoriser une résistance aux agents pathogènes lors des phases d’implantation dans la perspective d’identifier des leviers d’adaptation. Le traitement de deux pathosystèmes impliquant deux agents pathogènes ayant une forte incidence sur le colza, avec des mécanismes d’infection différents (l’un infectant les racines et l’autre pénétrant dans la plante par les cotylédons et feuilles puis migrant jusqu’au collet au printemps), avec une première étape clé d’infection à l’automne pour les deux agents pathogènes, permettra d’identifier des déterminants communs ou spécifiques offrant une vision large de cette adaptation.

Unités impliquées et partenariat

Partenaires

Contacts / coordination :